腸胃鏡檢查有分傳統內視鏡(胃鏡與大腸鏡)與無痛內視鏡檢查，之間的差別僅在於「麻醉藥」的使用，其餘步驟皆相同。曾做過傳統沒有麻醉的胃鏡或大腸鏡檢查的民眾，大都不願意在仍然清醒的狀態下再次承受這樣不適與疼痛。