披衣菌是介於細菌與濾過性病毒間的微生物，感染後症狀會在數周後出現，如骨盆腔的發炎或沾黏、陰道炎、子宮外孕、不孕症，但70%感染的女性沒有症狀。如果免疫球蛋白G陽性，則表示是以前得過但現在好了，有抗體了。

若有懷孕的打算，長期的發炎反應會導致輸卵管阻塞，輸卵管水腫或骨盆腔沾連。若懷孕了也容易導致子宮外孕的機率。孕婦遭披衣菌感染若未治療，有50%的機率造成新生兒結膜炎，容易導致新生兒失明。有20%機率導致新生兒肺炎或其他呼吸道疾病，嚴重時甚至引發死亡。

有披衣菌也不必擔心，只要服用有效的抗生素１～２週就可以痊癒，但記得與性伴侶要一起治療。若只有一方治療，好了之後性伴侶還是有可能經過性行為再感染。