本院健康管理中心隸屬社區醫學部，提供全方位的體檢服務，包括全民健保提供的免費成人健檢及花蓮縣政府提供的長者健檢，另外在自費方面有高階健檢、個人（學生）健檢、婚前健檢、勞工（巡迴）體檢、機車駕照體檢、軍校招生體檢、兵役體檢及軍人體檢、軍訓教官體檢等。