一般來說在免疫力正常的人身上，毛囊炎通常是會自己慢慢痊癒的。但有時比較嚴重的發炎或感染可能會讓疾病的時間拖長，或是症狀變得惡化，因此若是觀察症狀出現惡化（化膿、更加腫痛）、或是感染的範圍擴大，建議還是要去看醫師，讓醫師診斷出感染的原因對症下藥。通常症狀較輕微者，會先以外用的藥膏或洗劑來治療，若有需要則會加上口服藥合併使用。
毛囊炎較常見的原因是由於細菌、黴菌或是蟎蟲侵入毛囊，造成感染引起發炎反應。細菌性毛囊炎常見的菌種有金黃色葡萄球菌（Staphyloccocus）、抗藥性金黃葡萄球菌 MRSA（Methicillin-Resistant Staphylococcus Aureus）、綠膿桿菌（Pseudomonas aeruginosa）。但為什麼會是這些菌種呢？當然有原因。
細菌性毛囊炎
金黃色葡萄球菌（Staphylococcus）是人類皮膚上正常的菌叢，在免疫力正常的人身上不會造成感染，但當皮膚屏障處於抵抗力低下的狀態，或是皮膚出現傷口時，就會發生伺機性感染，也就是偷偷趁機感染你的意思啦！
抗藥性金黃葡萄球菌 MRSA（Methicillin-Resistant Staphylococcus Aureus）是一種突變型態的金黃色葡萄球菌（Staphylococcus Aureus），主要是因為抗生素的濫用，導致原本一般的金黃色葡萄球菌（Staphylococcus Aureus）產生了具有抗藥性的變種。這種細菌因為對多種抗生素都有抗藥性，因此在治療上能夠選用的藥物就更少了。
綠膿桿菌（Pseudomonas aeruginosa）毛囊炎的感染不同於上述的菌種，通常在泡溫泉、洗三溫暖、溫水游泳池等使用公共設施後發生，常又被稱為溫泉性毛囊炎（hot tub folliculitis）。
黴菌性毛囊炎
黴菌性毛囊炎常見的菌種為皮屑芽孢菌（Malassezia furfur）造成的感染。一般會給予抗黴菌藥物治療，口服抗黴菌藥常見的有 fluconazole 和 itraconazole 這兩種，而 ketoconazole 由於有較高的肝毒性風險故不建議以口服來使用，通常以外用的 ketoconazole 洗劑作為治療方式。在服用抗生素或抗黴菌藥物時需特別注意一定要按照醫囑服用完整個療程，不要因為病情有好轉就自行停藥了。若上述的經驗性療法仍無法改善毛囊炎的症狀則可能為較少見之菌種感染，需進一步進行細菌培養鎖定感染原因，進行更準確的治療。
毛囊炎的日常生活保養及預防發作
毛囊炎是很容易復發的疾病，畢竟毛囊炎的發作往往跟個人的體質與習慣有關。雖然體質很難改變，但習慣倒是可以努力改變的。要預防毛囊炎的復發並不困難，遵守以下幾個原則就可以減少毛囊炎發作的機會。針對毛囊炎患者的日常生活清潔與保養上，在文獻中提及了一些建議，我們整理如下。
- 適度清潔：建立良好的衛生習慣，保持肌膚的乾淨是最大的原則。如時常洗手保持手部的清潔。若在醫師評估後認為有需要時可選用具有殺菌效果的肥皂或沐浴乳（但並不鼓勵每個人都用殺菌效果產品來預防，避免抗藥性風險）。
- 正確除毛：建立正確的除毛觀念也是很重要的，如果你是毛囊炎的患者，我們會建議不要過於頻繁的除毛、減少刮鬍子的頻率、依照毛髮生長的方向來刮除以減少刮傷皮膚的機會，最重要的是一定要定期更換除毛的工具。
- 慎選保養：在選擇保養品方面，依照自己的膚況選擇適合的保養品，避免使用過度油膩的乳液、防曬產品，頭部產品如髮膠、髮蠟使用後也要適度的清潔，減少毛囊阻塞發炎的機會。
- 生活習慣：生活習慣方面避免食用過於辛辣油膩的刺激性食物，多吃蔬菜水果等富含維生素的食物。作息規律盡量避免熬夜保有良好的睡眠品質，注重自我壓力調適，保持心情放鬆才是根絕毛囊炎復發的最佳方法。
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