很多人對咖啡所含的物質，第一個想到的就是咖啡因，其實咖啡豆所含的物質相當多，所以咖啡對健康影響的面向，不只侷限在咖啡因的範疇。以下我們針對身體各部位來探討咖啡對身體的優缺點：
對頭部及腦部的影響
【優點】
1.減少阿茲海默症：許多研究發現，每天喝2 ～ 5杯咖啡的人，比每天不喝咖啡或是每天喝少於1杯的人，年老後較不容易得阿茲海默症。
2.增強認知的能力：根據研究，如果老年人能固定喝咖啡，可以增加認知能力及短期記憶力。
3.減少巴金森氏症的風險：研究結果顯示，有固定喝咖啡習慣的人，在年老之後得巴金森氏症的機會比較小。
4.減輕頭痛：咖啡因有止痛的效果，可以減輕偏頭痛及頭痛的症狀。
【缺點】
造成焦躁、睡眠障礙。
有些人喝過多的咖啡會有焦躁、不安、無法入睡的症狀。
對肝膽的影響
【優點】
1.減少脂肪肝的情形：有一些研究發現，喝咖啡的人能減少脂肪肝的發生，尤其是對因喝酒所引發的脂肪肝特別有預防效果。
2.減少膽結石機率：研究顯示每天若喝2 ～ 3杯咖啡，比從來不喝咖啡的人得到膽結石的機率少40％。但喝低咖啡因的人，罹患膽結石的機率沒有降低。
【缺點】
目前無發現
對心血管的影響
【優點】
1.減少女性心肌梗塞的機率。
2.西班牙有一個超過20 年的研究，從觀察喝咖啡造成的影響來看，發現女性每飲用天2 ～ 3 杯的咖啡，能降低心肌梗塞死亡率約25％。
【缺點】
1.增加膽固醇：咖啡豆裡含有咖啡油醇（cafesterol）這種化合物，會增加人體的膽固醇，尤其對女性的影響特別大。一般的咖啡如果直接用機器煮而沒有使用濾紙過濾，容易含有咖啡油醇；如果咖啡煮完再用濾紙過濾處理，則會去除絕大部分的咖啡油醇，減少增加膽固醇的危險。所以建議咖啡要用濾紙過濾。
2.增加貧血的危險：有人習慣飯後馬上來一杯咖啡，這樣很容易阻礙餐中的鐵質吸收，而造成缺鐵性貧血，最好餐後1 ～ 2 個小時再喝咖啡。
對腸胃道的影響
【優點】
1.可以幫助排便。
2.咖啡是一個幫助腸子蠕動很好的物質，排便不順時，可以試著喝一點黑咖啡，很快會有便意，能解除便祕現象。
【缺點】
1.有時容易傷胃。
2.咖啡容易對胃腸的黏膜有傷害，建議不要空腹喝咖啡。如果有胃炎、胃潰瘍或十二指腸潰瘍應停止喝咖啡。
對代謝的影響
【優點】
1.具有降低糖尿病的風險。
2.每天固定喝咖啡的人，能降低罹患第二型糖尿病的風險。
對婦女的影響
【缺點】
1.增加骨質疏鬆的風險：喝咖啡對停經後的婦女骨質密度影響比較大，停經後婦女喝大量咖啡會增加骨質疏鬆症的危險，建議停經後婦女喝咖啡時，每天以2杯為限，而且喝咖啡時最好要加牛奶( 不是加奶精或奶油球)。
2.增加早產的風險：研究發現，咖啡攝取量越多，懷孕婦女早產的機率越高，因此懷孕婦女最好不要喝咖啡，若真的要喝，以1杯淺嚐為止。
映蓉博士的健康小叮嚀
1. 每個人應依自己的身體狀況來飲用咖啡，學習查詢或詢問經常飲用咖啡的咖啡因含量，每天以不超過300 毫克的咖啡因最為安全。
2. 不管喝哪一種咖啡，建議先以濾紙過濾，可以過濾掉增加膽固醇的物質。
3. 飯後不要馬上喝咖啡以免影響鐵質吸收，長期造成貧血。
4. 停經後婦女如要飲用咖啡，建議在咖啡中加牛奶。
本文引用來源：【一個人到一家人的日常營養學】，吳映蓉著，臉譜出版